Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr2e1Q64104 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr2e1Q64104 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Nr2e1Q64104 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nr2e1Q64104 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Nr2e1Q64104 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nr2e1Q64104 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nr2e1Q64104 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nr2e1Q64104 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nr2e1Q64104 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Nr2e1Q64104 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nr2e1Q64104 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nr2e1Q64104 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nr2e1Q64104 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nr2e1Q64104 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nr2e1Q64104 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nr2e1Q64104 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nr2e1Q64104 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nr2e1Q64104 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nr2e1Q64104 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nr2e1Q64104 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nr2e1Q64104 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nr2e1Q64104 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Nr2e1Q64104 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nr2e1Q64104 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nr2e1Q64104 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Nr2e1Q64104 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nr2e1Q64104 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nr2e1Q64104 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nr2e1Q64104 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nr2e1Q64104 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nr2e1Q64104 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nr2e1Q64104 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Nr2e1Q64104 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nr2e1Q64104 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nr2e1Q64104 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nr2e1Q64104 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nr2e1Q64104 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nr2e1Q64104 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nr2e1Q64104 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nr2e1Q64104 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nr2e1Q64104 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nr2e1Q64104 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms