Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pan3Q640Q5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pan3Q640Q5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pan3Q640Q5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pan3Q640Q5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pan3Q640Q5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pan3Q640Q5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pan3Q640Q5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pan3Q640Q5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms