Protein–RNA interactions for Protein: Q640M6

Gdpd5, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd5Q640M6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gdpd5Q640M6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gdpd5Q640M6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gdpd5Q640M6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdpd5Q640M6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gdpd5Q640M6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gdpd5Q640M6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdpd5Q640M6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdpd5Q640M6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gdpd5Q640M6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gdpd5Q640M6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gdpd5Q640M6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gdpd5Q640M6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gdpd5Q640M6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gdpd5Q640M6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gdpd5Q640M6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gdpd5Q640M6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gdpd5Q640M6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gdpd5Q640M6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gdpd5Q640M6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdpd5Q640M6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gdpd5Q640M6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gdpd5Q640M6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gdpd5Q640M6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdpd5Q640M6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gdpd5Q640M6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gdpd5Q640M6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gdpd5Q640M6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdpd5Q640M6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdpd5Q640M6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gdpd5Q640M6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdpd5Q640M6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdpd5Q640M6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdpd5Q640M6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdpd5Q640M6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gdpd5Q640M6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gdpd5Q640M6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gdpd5Q640M6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gdpd5Q640M6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gdpd5Q640M6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdpd5Q640M6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdpd5Q640M6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gdpd5Q640M6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gdpd5Q640M6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdpd5Q640M6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdpd5Q640M6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdpd5Q640M6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gdpd5Q640M6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd5Q640M6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gdpd5Q640M6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms