Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm20854Q62461 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20854Q62461 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm20854Q62461 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm20854Q62461 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm20854Q62461 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm20854Q62461 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Gm20854Q62461 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm20854Q62461 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm20854Q62461 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm20854Q62461 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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