Protein–RNA interactions for Protein: Q62398

Cnga2, Cyclic nucleotide-gated olfactory channel, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga2Q62398 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cnga2Q62398 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnga2Q62398 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnga2Q62398 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnga2Q62398 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnga2Q62398 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnga2Q62398 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnga2Q62398 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnga2Q62398 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnga2Q62398 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cnga2Q62398 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cnga2Q62398 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cnga2Q62398 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnga2Q62398 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cnga2Q62398 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cnga2Q62398 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Cnga2Q62398 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cnga2Q62398 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cnga2Q62398 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cnga2Q62398 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cnga2Q62398 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnga2Q62398 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cnga2Q62398 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cnga2Q62398 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnga2Q62398 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnga2Q62398 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cnga2Q62398 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnga2Q62398 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cnga2Q62398 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cnga2Q62398 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cnga2Q62398 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cnga2Q62398 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cnga2Q62398 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cnga2Q62398 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnga2Q62398 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnga2Q62398 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cnga2Q62398 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cnga2Q62398 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnga2Q62398 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnga2Q62398 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnga2Q62398 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnga2Q62398 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnga2Q62398 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnga2Q62398 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnga2Q62398 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnga2Q62398 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnga2Q62398 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnga2Q62398 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cnga2Q62398 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cnga2Q62398 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms