Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
TrhQ62361 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC31,16■■■□□ 2,58
TrhQ62361 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,57
TrhQ62361 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC31,13■■■□□ 2,57
TrhQ62361 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
TrhQ62361 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31,11■■■□□ 2,57
TrhQ62361 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
TrhQ62361 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
TrhQ62361 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
TrhQ62361 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
TrhQ62361 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,57
TrhQ62361 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,57
TrhQ62361 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31,07■■■□□ 2,56
TrhQ62361 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
TrhQ62361 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31,06■■■□□ 2,56
TrhQ62361 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC31,05■■■□□ 2,56
TrhQ62361 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
TrhQ62361 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31,04■■■□□ 2,56
TrhQ62361 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
TrhQ62361 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
TrhQ62361 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC31,03■■■□□ 2,56
TrhQ62361 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
TrhQ62361 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,56
TrhQ62361 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
TrhQ62361 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC31■■■□□ 2,55
TrhQ62361 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
TrhQ62361 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
TrhQ62361 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2,55
TrhQ62361 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
TrhQ62361 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
TrhQ62361 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
TrhQ62361 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
TrhQ62361 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
TrhQ62361 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30,96■■■□□ 2,55
TrhQ62361 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30,96■■■□□ 2,55
TrhQ62361 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
TrhQ62361 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
TrhQ62361 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30,94■■■□□ 2,54
TrhQ62361 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
TrhQ62361 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,91■■■□□ 2,54
TrhQ62361 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,9■■■□□ 2,54
TrhQ62361 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,89■■■□□ 2,54
TrhQ62361 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,89■■■□□ 2,53
TrhQ62361 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
TrhQ62361 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
TrhQ62361 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
TrhQ62361 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30,83■■■□□ 2,53
TrhQ62361 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,83■■■□□ 2,53
TrhQ62361 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
TrhQ62361 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
TrhQ62361 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30,81■■■□□ 2,52
TrhQ62361 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30,81■■■□□ 2,52
TrhQ62361 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,79■■■□□ 2,52
TrhQ62361 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,78■■■□□ 2,52
TrhQ62361 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
TrhQ62361 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
TrhQ62361 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30,76■■■□□ 2,51
TrhQ62361 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
TrhQ62361 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30,75■■■□□ 2,51
TrhQ62361 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
TrhQ62361 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,73■■■□□ 2,51
TrhQ62361 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
TrhQ62361 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
TrhQ62361 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30,71■■■□□ 2,51
TrhQ62361 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
TrhQ62361 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,69■■■□□ 2,5
TrhQ62361 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
TrhQ62361 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
TrhQ62361 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30,68■■■□□ 2,5
TrhQ62361 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
TrhQ62361 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30,67■■■□□ 2,5
TrhQ62361 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
TrhQ62361 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30,66■■■□□ 2,5
TrhQ62361 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
TrhQ62361 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
TrhQ62361 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
TrhQ62361 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
TrhQ62361 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
TrhQ62361 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
TrhQ62361 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,63■■■□□ 2,49
TrhQ62361 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
TrhQ62361 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
TrhQ62361 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
TrhQ62361 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
TrhQ62361 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,61■■■□□ 2,49
TrhQ62361 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30,59■■■□□ 2,49
TrhQ62361 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
TrhQ62361 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
TrhQ62361 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
TrhQ62361 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
TrhQ62361 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
TrhQ62361 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
TrhQ62361 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30,56■■■□□ 2,48
TrhQ62361 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC30,55■■■□□ 2,48
TrhQ62361 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
TrhQ62361 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
TrhQ62361 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
TrhQ62361 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
TrhQ62361 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
TrhQ62361 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms