Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SypQ62277 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SypQ62277 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SypQ62277 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SypQ62277 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SypQ62277 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SypQ62277 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SypQ62277 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SypQ62277 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SypQ62277 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SypQ62277 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SypQ62277 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SypQ62277 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SypQ62277 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SypQ62277 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SypQ62277 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SypQ62277 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SypQ62277 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SypQ62277 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SypQ62277 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SypQ62277 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SypQ62277 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SypQ62277 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SypQ62277 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SypQ62277 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SypQ62277 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SypQ62277 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SypQ62277 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SypQ62277 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SypQ62277 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SypQ62277 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SypQ62277 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SypQ62277 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SypQ62277 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SypQ62277 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SypQ62277 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SypQ62277 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SypQ62277 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SypQ62277 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SypQ62277 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SypQ62277 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SypQ62277 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SypQ62277 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SypQ62277 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SypQ62277 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SypQ62277 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SypQ62277 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SypQ62277 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SypQ62277 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SypQ62277 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SypQ62277 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SypQ62277 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SypQ62277 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SypQ62277 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SypQ62277 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SypQ62277 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SypQ62277 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SypQ62277 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SypQ62277 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SypQ62277 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SypQ62277 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SypQ62277 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SypQ62277 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SypQ62277 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SypQ62277 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SypQ62277 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SypQ62277 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SypQ62277 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SypQ62277 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SypQ62277 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SypQ62277 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SypQ62277 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SypQ62277 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SypQ62277 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SypQ62277 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SypQ62277 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SypQ62277 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SypQ62277 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SypQ62277 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SypQ62277 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SypQ62277 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SypQ62277 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SypQ62277 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SypQ62277 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SypQ62277 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SypQ62277 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SypQ62277 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SypQ62277 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SypQ62277 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SypQ62277 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SypQ62277 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SypQ62277 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SypQ62277 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SypQ62277 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SypQ62277 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SypQ62277 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SypQ62277 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SypQ62277 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SypQ62277 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SypQ62277 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms