Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Six3Q62233 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Six3Q62233 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Six3Q62233 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Six3Q62233 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six3Q62233 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Six3Q62233 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Six3Q62233 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Six3Q62233 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six3Q62233 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six3Q62233 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Six3Q62233 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six3Q62233 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six3Q62233 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six3Q62233 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Six3Q62233 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Six3Q62233 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Six3Q62233 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Six3Q62233 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Six3Q62233 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six3Q62233 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Six3Q62233 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Six3Q62233 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Six3Q62233 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Six3Q62233 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Six3Q62233 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six3Q62233 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six3Q62233 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Six3Q62233 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six3Q62233 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Six3Q62233 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Six3Q62233 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Six3Q62233 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Six3Q62233 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Six3Q62233 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Six3Q62233 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Six3Q62233 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six3Q62233 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Six3Q62233 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Six3Q62233 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six3Q62233 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Six3Q62233 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six3Q62233 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Six3Q62233 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six3Q62233 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six3Q62233 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six3Q62233 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Six3Q62233 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Six3Q62233 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six3Q62233 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six3Q62233 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six3Q62233 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Six3Q62233 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Six3Q62233 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six3Q62233 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six3Q62233 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Six3Q62233 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Six3Q62233 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Six3Q62233 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Six3Q62233 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Six3Q62233 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Six3Q62233 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Six3Q62233 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Six3Q62233 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Six3Q62233 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Six3Q62233 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six3Q62233 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six3Q62233 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Six3Q62233 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Six3Q62233 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Six3Q62233 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Six3Q62233 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Six3Q62233 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Six3Q62233 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Six3Q62233 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Six3Q62233 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Six3Q62233 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Six3Q62233 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Six3Q62233 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms