Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Six1Q62231 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Six1Q62231 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Six1Q62231 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Six1Q62231 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Six1Q62231 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Six1Q62231 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Six1Q62231 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Six1Q62231 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Six1Q62231 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Six1Q62231 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Six1Q62231 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Six1Q62231 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Six1Q62231 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Six1Q62231 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Six1Q62231 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Six1Q62231 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Six1Q62231 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Six1Q62231 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Six1Q62231 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Six1Q62231 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Six1Q62231 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Six1Q62231 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Six1Q62231 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Six1Q62231 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Six1Q62231 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Six1Q62231 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Six1Q62231 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Six1Q62231 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Six1Q62231 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Six1Q62231 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Six1Q62231 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Six1Q62231 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Six1Q62231 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Six1Q62231 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Six1Q62231 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Six1Q62231 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Six1Q62231 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Six1Q62231 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Six1Q62231 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Six1Q62231 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Six1Q62231 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Six1Q62231 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Six1Q62231 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Six1Q62231 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Six1Q62231 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Six1Q62231 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Six1Q62231 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Six1Q62231 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Six1Q62231 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Six1Q62231 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Six1Q62231 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Six1Q62231 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Six1Q62231 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Six1Q62231 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Six1Q62231 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Six1Q62231 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Six1Q62231 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Six1Q62231 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Six1Q62231 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Six1Q62231 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Six1Q62231 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Six1Q62231 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Six1Q62231 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Six1Q62231 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Six1Q62231 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Six1Q62231 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Six1Q62231 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Six1Q62231 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Six1Q62231 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Six1Q62231 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Six1Q62231 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Six1Q62231 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Six1Q62231 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Six1Q62231 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Six1Q62231 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Six1Q62231 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Six1Q62231 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Six1Q62231 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Six1Q62231 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Six1Q62231 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms