Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sycp1Q62209 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sycp1Q62209 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sycp1Q62209 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sycp1Q62209 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sycp1Q62209 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sycp1Q62209 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp1Q62209 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp1Q62209 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sycp1Q62209 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sycp1Q62209 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sycp1Q62209 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp1Q62209 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp1Q62209 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sycp1Q62209 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sycp1Q62209 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sycp1Q62209 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sycp1Q62209 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sycp1Q62209 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sycp1Q62209 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp1Q62209 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp1Q62209 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp1Q62209 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp1Q62209 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp1Q62209 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp1Q62209 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp1Q62209 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sycp1Q62209 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp1Q62209 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp1Q62209 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp1Q62209 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp1Q62209 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp1Q62209 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp1Q62209 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sycp1Q62209 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sycp1Q62209 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sycp1Q62209 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp1Q62209 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sycp1Q62209 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp1Q62209 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sycp1Q62209 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sycp1Q62209 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp1Q62209 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sycp1Q62209 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sycp1Q62209 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sycp1Q62209 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp1Q62209 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp1Q62209 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sycp1Q62209 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sycp1Q62209 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Sycp1Q62209 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms