Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3bQ62141 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sin3bQ62141 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sin3bQ62141 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sin3bQ62141 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sin3bQ62141 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sin3bQ62141 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sin3bQ62141 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sin3bQ62141 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sin3bQ62141 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sin3bQ62141 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sin3bQ62141 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3bQ62141 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3bQ62141 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sin3bQ62141 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3bQ62141 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sin3bQ62141 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3bQ62141 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sin3bQ62141 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Sin3bQ62141 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sin3bQ62141 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sin3bQ62141 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sin3bQ62141 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sin3bQ62141 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sin3bQ62141 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sin3bQ62141 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3bQ62141 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3bQ62141 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3bQ62141 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sin3bQ62141 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3bQ62141 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3bQ62141 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sin3bQ62141 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sin3bQ62141 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sin3bQ62141 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sin3bQ62141 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sin3bQ62141 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sin3bQ62141 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sin3bQ62141 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sin3bQ62141 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sin3bQ62141 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sin3bQ62141 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sin3bQ62141 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sin3bQ62141 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sin3bQ62141 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sin3bQ62141 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3bQ62141 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sin3bQ62141 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms