Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pacsin1Q61644 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pacsin1Q61644 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pacsin1Q61644 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pacsin1Q61644 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pacsin1Q61644 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Pacsin1Q61644 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pacsin1Q61644 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pacsin1Q61644 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pacsin1Q61644 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pacsin1Q61644 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pacsin1Q61644 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pacsin1Q61644 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pacsin1Q61644 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pacsin1Q61644 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pacsin1Q61644 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pacsin1Q61644 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pacsin1Q61644 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Pacsin1Q61644 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pacsin1Q61644 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pacsin1Q61644 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pacsin1Q61644 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pacsin1Q61644 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pacsin1Q61644 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pacsin1Q61644 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pacsin1Q61644 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pacsin1Q61644 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pacsin1Q61644 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pacsin1Q61644 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pacsin1Q61644 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pacsin1Q61644 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pacsin1Q61644 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pacsin1Q61644 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Pacsin1Q61644 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pacsin1Q61644 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pacsin1Q61644 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pacsin1Q61644 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pacsin1Q61644 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pacsin1Q61644 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pacsin1Q61644 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pacsin1Q61644 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pacsin1Q61644 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pacsin1Q61644 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pacsin1Q61644 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pacsin1Q61644 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pacsin1Q61644 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pacsin1Q61644 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pacsin1Q61644 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pacsin1Q61644 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pacsin1Q61644 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pacsin1Q61644 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pacsin1Q61644 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms