Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifi47Q61635 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifi47Q61635 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ifi47Q61635 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ifi47Q61635 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ifi47Q61635 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ifi47Q61635 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifi47Q61635 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ifi47Q61635 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ifi47Q61635 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ifi47Q61635 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.2 ms