Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gbp4Q61107 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gbp4Q61107 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gbp4Q61107 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gbp4Q61107 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gbp4Q61107 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gbp4Q61107 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.9 ms