Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sim1Q61045 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sim1Q61045 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sim1Q61045 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sim1Q61045 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sim1Q61045 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sim1Q61045 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sim1Q61045 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sim1Q61045 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sim1Q61045 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sim1Q61045 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sim1Q61045 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sim1Q61045 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sim1Q61045 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sim1Q61045 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sim1Q61045 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sim1Q61045 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sim1Q61045 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sim1Q61045 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sim1Q61045 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sim1Q61045 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sim1Q61045 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sim1Q61045 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sim1Q61045 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sim1Q61045 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sim1Q61045 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sim1Q61045 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sim1Q61045 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sim1Q61045 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sim1Q61045 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sim1Q61045 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sim1Q61045 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sim1Q61045 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sim1Q61045 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.1 ms