Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Laptm4aQ60961 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Laptm4aQ60961 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Laptm4aQ60961 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Laptm4aQ60961 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Laptm4aQ60961 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Laptm4aQ60961 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Laptm4aQ60961 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Laptm4aQ60961 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Laptm4aQ60961 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Laptm4aQ60961 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Laptm4aQ60961 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Laptm4aQ60961 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Laptm4aQ60961 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Laptm4aQ60961 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Laptm4aQ60961 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Laptm4aQ60961 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Laptm4aQ60961 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Laptm4aQ60961 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms