Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Meis1Q60954 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Meis1Q60954 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Meis1Q60954 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Meis1Q60954 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Meis1Q60954 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Meis1Q60954 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Meis1Q60954 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Meis1Q60954 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Meis1Q60954 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Meis1Q60954 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Meis1Q60954 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Meis1Q60954 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Meis1Q60954 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Meis1Q60954 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Meis1Q60954 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Meis1Q60954 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Meis1Q60954 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Meis1Q60954 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Meis1Q60954 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Meis1Q60954 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Meis1Q60954 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Meis1Q60954 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Meis1Q60954 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Meis1Q60954 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Meis1Q60954 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Meis1Q60954 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Meis1Q60954 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Meis1Q60954 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Meis1Q60954 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Meis1Q60954 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Meis1Q60954 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Meis1Q60954 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Meis1Q60954 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Meis1Q60954 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Meis1Q60954 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Meis1Q60954 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Meis1Q60954 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Meis1Q60954 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Meis1Q60954 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Meis1Q60954 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Meis1Q60954 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Meis1Q60954 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Meis1Q60954 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Meis1Q60954 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Meis1Q60954 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Meis1Q60954 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Meis1Q60954 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Meis1Q60954 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Meis1Q60954 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Meis1Q60954 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Meis1Q60954 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Meis1Q60954 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Meis1Q60954 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Meis1Q60954 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Meis1Q60954 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Meis1Q60954 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Meis1Q60954 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Meis1Q60954 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Meis1Q60954 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Meis1Q60954 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Meis1Q60954 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Meis1Q60954 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Meis1Q60954 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Meis1Q60954 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Meis1Q60954 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Meis1Q60954 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Meis1Q60954 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Meis1Q60954 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms