Protein–RNA interactions for Protein: Q60754

Marco, Macrophage receptor MARCO, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MarcoQ60754 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MarcoQ60754 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MarcoQ60754 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MarcoQ60754 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MarcoQ60754 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MarcoQ60754 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MarcoQ60754 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MarcoQ60754 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MarcoQ60754 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MarcoQ60754 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MarcoQ60754 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MarcoQ60754 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MarcoQ60754 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MarcoQ60754 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MarcoQ60754 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MarcoQ60754 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MarcoQ60754 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MarcoQ60754 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MarcoQ60754 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MarcoQ60754 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MarcoQ60754 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MarcoQ60754 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MarcoQ60754 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MarcoQ60754 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MarcoQ60754 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MarcoQ60754 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MarcoQ60754 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MarcoQ60754 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MarcoQ60754 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MarcoQ60754 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MarcoQ60754 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MarcoQ60754 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MarcoQ60754 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MarcoQ60754 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MarcoQ60754 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MarcoQ60754 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MarcoQ60754 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MarcoQ60754 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MarcoQ60754 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms