Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epha1Q60750 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epha1Q60750 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epha1Q60750 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epha1Q60750 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Epha1Q60750 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epha1Q60750 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Epha1Q60750 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epha1Q60750 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epha1Q60750 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epha1Q60750 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epha1Q60750 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Epha1Q60750 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Epha1Q60750 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epha1Q60750 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epha1Q60750 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epha1Q60750 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epha1Q60750 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epha1Q60750 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Epha1Q60750 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Epha1Q60750 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha1Q60750 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha1Q60750 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha1Q60750 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Epha1Q60750 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Epha1Q60750 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Epha1Q60750 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms