Protein–RNA interactions for Protein: Q60738

Slc30a1, Zinc transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a1Q60738 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc30a1Q60738 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc30a1Q60738 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc30a1Q60738 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc30a1Q60738 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc30a1Q60738 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc30a1Q60738 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc30a1Q60738 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc30a1Q60738 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc30a1Q60738 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc30a1Q60738 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc30a1Q60738 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc30a1Q60738 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc30a1Q60738 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc30a1Q60738 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms