Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2aQ60648 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2aQ60648 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2aQ60648 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2aQ60648 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm2aQ60648 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm2aQ60648 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms