Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYD0

Myo1d, Unconventional myosin-Id, mousemouse

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1dQ5SYD0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myo1dQ5SYD0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Myo1dQ5SYD0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Myo1dQ5SYD0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Myo1dQ5SYD0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Myo1dQ5SYD0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myo1dQ5SYD0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Myo1dQ5SYD0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Myo1dQ5SYD0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Myo1dQ5SYD0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Myo1dQ5SYD0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Myo1dQ5SYD0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Myo1dQ5SYD0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Myo1dQ5SYD0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Myo1dQ5SYD0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Myo1dQ5SYD0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo1dQ5SYD0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Myo1dQ5SYD0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Myo1dQ5SYD0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo1dQ5SYD0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Myo1dQ5SYD0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo1dQ5SYD0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Myo1dQ5SYD0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Myo1dQ5SYD0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo1dQ5SYD0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo1dQ5SYD0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo1dQ5SYD0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo1dQ5SYD0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Myo1dQ5SYD0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Myo1dQ5SYD0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo1dQ5SYD0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Myo1dQ5SYD0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myo1dQ5SYD0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Myo1dQ5SYD0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Myo1dQ5SYD0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo1dQ5SYD0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo1dQ5SYD0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo1dQ5SYD0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Myo1dQ5SYD0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Myo1dQ5SYD0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo1dQ5SYD0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Myo1dQ5SYD0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo1dQ5SYD0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Myo1dQ5SYD0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Myo1dQ5SYD0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Myo1dQ5SYD0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Myo1dQ5SYD0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo1dQ5SYD0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Myo1dQ5SYD0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms