Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znrf3Q5SSZ7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Znrf3Q5SSZ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Znrf3Q5SSZ7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Znrf3Q5SSZ7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Znrf3Q5SSZ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Znrf3Q5SSZ7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Znrf3Q5SSZ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Znrf3Q5SSZ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znrf3Q5SSZ7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms