Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27,52■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Cacna2d4Q5RJF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Cacna2d4Q5RJF7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Cacna2d4Q5RJF7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Cacna2d4Q5RJF7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Cacna2d4Q5RJF7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Cacna2d4Q5RJF7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Cacna2d4Q5RJF7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Cacna2d4Q5RJF7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cacna2d4Q5RJF7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cacna2d4Q5RJF7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Cacna2d4Q5RJF7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cacna2d4Q5RJF7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27,34■■□□□ 1,97
Cacna2d4Q5RJF7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cacna2d4Q5RJF7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cacna2d4Q5RJF7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cacna2d4Q5RJF7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Cacna2d4Q5RJF7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Cacna2d4Q5RJF7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Cacna2d4Q5RJF7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Cacna2d4Q5RJF7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Cacna2d4Q5RJF7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Cacna2d4Q5RJF7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Cacna2d4Q5RJF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cacna2d4Q5RJF7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Cacna2d4Q5RJF7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Cacna2d4Q5RJF7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Cacna2d4Q5RJF7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Cacna2d4Q5RJF7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Cacna2d4Q5RJF7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Cacna2d4Q5RJF7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cacna2d4Q5RJF7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cacna2d4Q5RJF7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cacna2d4Q5RJF7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Cacna2d4Q5RJF7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Cacna2d4Q5RJF7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Cacna2d4Q5RJF7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Cacna2d4Q5RJF7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Cacna2d4Q5RJF7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Cacna2d4Q5RJF7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cacna2d4Q5RJF7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Cacna2d4Q5RJF7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Cacna2d4Q5RJF7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cacna2d4Q5RJF7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Cacna2d4Q5RJF7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms