Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cacna2d4Q5RJF7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cacna2d4Q5RJF7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cacna2d4Q5RJF7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cacna2d4Q5RJF7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cacna2d4Q5RJF7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cacna2d4Q5RJF7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cacna2d4Q5RJF7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cacna2d4Q5RJF7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna2d4Q5RJF7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna2d4Q5RJF7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna2d4Q5RJF7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna2d4Q5RJF7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cacna2d4Q5RJF7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna2d4Q5RJF7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna2d4Q5RJF7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna2d4Q5RJF7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna2d4Q5RJF7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna2d4Q5RJF7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cacna2d4Q5RJF7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cacna2d4Q5RJF7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cacna2d4Q5RJF7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna2d4Q5RJF7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna2d4Q5RJF7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cacna2d4Q5RJF7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cacna2d4Q5RJF7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacna2d4Q5RJF7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cacna2d4Q5RJF7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cacna2d4Q5RJF7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna2d4Q5RJF7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cacna2d4Q5RJF7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacna2d4Q5RJF7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cacna2d4Q5RJF7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna2d4Q5RJF7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna2d4Q5RJF7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna2d4Q5RJF7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cacna2d4Q5RJF7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cacna2d4Q5RJF7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna2d4Q5RJF7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cacna2d4Q5RJF7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cacna2d4Q5RJF7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cacna2d4Q5RJF7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cacna2d4Q5RJF7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cacna2d4Q5RJF7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cacna2d4Q5RJF7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms