Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3558Q5FWC9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3558Q5FWC9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3558Q5FWC9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3558Q5FWC9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3558Q5FWC9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3558Q5FWC9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3558Q5FWC9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3558Q5FWC9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3558Q5FWC9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3558Q5FWC9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3558Q5FWC9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3558Q5FWC9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3558Q5FWC9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3558Q5FWC9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3558Q5FWC9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3558Q5FWC9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3558Q5FWC9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3558Q5FWC9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3558Q5FWC9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3558Q5FWC9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3558Q5FWC9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3558Q5FWC9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3558Q5FWC9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3558Q5FWC9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3558Q5FWC9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3558Q5FWC9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm3558Q5FWC9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm3558Q5FWC9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3558Q5FWC9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3558Q5FWC9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm3558Q5FWC9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3558Q5FWC9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm3558Q5FWC9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3558Q5FWC9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm3558Q5FWC9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3558Q5FWC9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm3558Q5FWC9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3558Q5FWC9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm3558Q5FWC9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3558Q5FWC9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3558Q5FWC9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms