Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sfmbt2Q5DTW2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sfmbt2Q5DTW2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sfmbt2Q5DTW2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sfmbt2Q5DTW2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sfmbt2Q5DTW2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sfmbt2Q5DTW2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfmbt2Q5DTW2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfmbt2Q5DTW2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sfmbt2Q5DTW2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sfmbt2Q5DTW2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sfmbt2Q5DTW2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sfmbt2Q5DTW2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfmbt2Q5DTW2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfmbt2Q5DTW2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfmbt2Q5DTW2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Sfmbt2Q5DTW2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sfmbt2Q5DTW2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sfmbt2Q5DTW2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sfmbt2Q5DTW2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sfmbt2Q5DTW2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sfmbt2Q5DTW2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sfmbt2Q5DTW2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sfmbt2Q5DTW2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sfmbt2Q5DTW2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms