Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam208bQ5DTT3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam208bQ5DTT3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fam208bQ5DTT3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fam208bQ5DTT3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fam208bQ5DTT3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam208bQ5DTT3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam208bQ5DTT3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fam208bQ5DTT3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam208bQ5DTT3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam208bQ5DTT3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam208bQ5DTT3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fam208bQ5DTT3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam208bQ5DTT3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam208bQ5DTT3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam208bQ5DTT3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam208bQ5DTT3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam208bQ5DTT3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam208bQ5DTT3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam208bQ5DTT3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam208bQ5DTT3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam208bQ5DTT3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam208bQ5DTT3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam208bQ5DTT3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam208bQ5DTT3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam208bQ5DTT3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam208bQ5DTT3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam208bQ5DTT3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam208bQ5DTT3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam208bQ5DTT3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam208bQ5DTT3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam208bQ5DTT3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam208bQ5DTT3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam208bQ5DTT3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam208bQ5DTT3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam208bQ5DTT3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam208bQ5DTT3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam208bQ5DTT3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam208bQ5DTT3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam208bQ5DTT3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam208bQ5DTT3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam208bQ5DTT3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam208bQ5DTT3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam208bQ5DTT3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam208bQ5DTT3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam208bQ5DTT3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam208bQ5DTT3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam208bQ5DTT3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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