Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Syce1lQ5D525 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Syce1lQ5D525 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Syce1lQ5D525 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Syce1lQ5D525 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Syce1lQ5D525 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Syce1lQ5D525 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Syce1lQ5D525 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Syce1lQ5D525 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Syce1lQ5D525 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Syce1lQ5D525 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Syce1lQ5D525 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23,06■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,05■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23,04■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Syce1lQ5D525 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22,99■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Syce1lQ5D525 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Syce1lQ5D525 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Syce1lQ5D525 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Syce1lQ5D525 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Syce1lQ5D525 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Syce1lQ5D525 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Syce1lQ5D525 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Syce1lQ5D525 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Syce1lQ5D525 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Syce1lQ5D525 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Syce1lQ5D525 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Syce1lQ5D525 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Syce1lQ5D525 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Syce1lQ5D525 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Syce1lQ5D525 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Syce1lQ5D525 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22,81■■□□□ 1,24
Syce1lQ5D525 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Syce1lQ5D525 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Syce1lQ5D525 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22,81■■□□□ 1,24
Syce1lQ5D525 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Syce1lQ5D525 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Syce1lQ5D525 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,1 ms