Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Opa3Q505D7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Opa3Q505D7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Opa3Q505D7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Opa3Q505D7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Opa3Q505D7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Opa3Q505D7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opa3Q505D7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Opa3Q505D7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opa3Q505D7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opa3Q505D7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opa3Q505D7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opa3Q505D7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opa3Q505D7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Opa3Q505D7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opa3Q505D7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opa3Q505D7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opa3Q505D7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opa3Q505D7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opa3Q505D7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opa3Q505D7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opa3Q505D7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Opa3Q505D7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Opa3Q505D7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Opa3Q505D7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms