Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdp2Q504M2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdp2Q504M2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdp2Q504M2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pdp2Q504M2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdp2Q504M2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pdp2Q504M2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdp2Q504M2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pdp2Q504M2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pdp2Q504M2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdp2Q504M2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdp2Q504M2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdp2Q504M2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdp2Q504M2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms