Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf109Q499E6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf109Q499E6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf109Q499E6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf109Q499E6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf109Q499E6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf109Q499E6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf109Q499E6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf109Q499E6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf109Q499E6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf109Q499E6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf109Q499E6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1orf109Q499E6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf109Q499E6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1orf109Q499E6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf109Q499E6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf109Q499E6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1orf109Q499E6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf109Q499E6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf109Q499E6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q499E6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf109Q499E6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf109Q499E6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf109Q499E6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf109Q499E6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C1orf109Q499E6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf109Q499E6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C1orf109Q499E6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q499E6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C1orf109Q499E6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C1orf109Q499E6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf109Q499E6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C1orf109Q499E6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf109Q499E6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf109Q499E6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf109Q499E6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C1orf109Q499E6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf109Q499E6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C1orf109Q499E6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf109Q499E6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf109Q499E6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1orf109Q499E6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf109Q499E6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf109Q499E6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1orf109Q499E6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf109Q499E6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf109Q499E6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1orf109Q499E6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms