Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Clul1Q3ZRW6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Clul1Q3ZRW6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Clul1Q3ZRW6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Clul1Q3ZRW6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Clul1Q3ZRW6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Clul1Q3ZRW6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,19
Clul1Q3ZRW6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Clul1Q3ZRW6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Clul1Q3ZRW6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Clul1Q3ZRW6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Clul1Q3ZRW6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Clul1Q3ZRW6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Clul1Q3ZRW6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Clul1Q3ZRW6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Clul1Q3ZRW6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Clul1Q3ZRW6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Clul1Q3ZRW6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Clul1Q3ZRW6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Clul1Q3ZRW6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Clul1Q3ZRW6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Clul1Q3ZRW6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Clul1Q3ZRW6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Clul1Q3ZRW6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Clul1Q3ZRW6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Clul1Q3ZRW6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Clul1Q3ZRW6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Clul1Q3ZRW6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Clul1Q3ZRW6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Clul1Q3ZRW6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Clul1Q3ZRW6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Clul1Q3ZRW6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Clul1Q3ZRW6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Clul1Q3ZRW6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Clul1Q3ZRW6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Clul1Q3ZRW6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Clul1Q3ZRW6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Clul1Q3ZRW6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Clul1Q3ZRW6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Clul1Q3ZRW6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Clul1Q3ZRW6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Clul1Q3ZRW6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Clul1Q3ZRW6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Clul1Q3ZRW6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Clul1Q3ZRW6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Clul1Q3ZRW6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Clul1Q3ZRW6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Clul1Q3ZRW6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Clul1Q3ZRW6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Clul1Q3ZRW6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Clul1Q3ZRW6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Clul1Q3ZRW6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Clul1Q3ZRW6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Clul1Q3ZRW6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Clul1Q3ZRW6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Clul1Q3ZRW6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Clul1Q3ZRW6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Clul1Q3ZRW6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Clul1Q3ZRW6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Clul1Q3ZRW6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Clul1Q3ZRW6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Clul1Q3ZRW6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Clul1Q3ZRW6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Clul1Q3ZRW6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Clul1Q3ZRW6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Clul1Q3ZRW6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Clul1Q3ZRW6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Clul1Q3ZRW6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Clul1Q3ZRW6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Clul1Q3ZRW6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Clul1Q3ZRW6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Clul1Q3ZRW6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Clul1Q3ZRW6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Clul1Q3ZRW6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Clul1Q3ZRW6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Clul1Q3ZRW6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Clul1Q3ZRW6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Clul1Q3ZRW6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Clul1Q3ZRW6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Clul1Q3ZRW6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Clul1Q3ZRW6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Clul1Q3ZRW6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Clul1Q3ZRW6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Clul1Q3ZRW6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Clul1Q3ZRW6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Clul1Q3ZRW6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
Clul1Q3ZRW6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Clul1Q3ZRW6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms