Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
6430531B16RikQ3V2J1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
6430531B16RikQ3V2J1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
6430531B16RikQ3V2J1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
6430531B16RikQ3V2J1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
6430531B16RikQ3V2J1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
6430531B16RikQ3V2J1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
6430531B16RikQ3V2J1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
6430531B16RikQ3V2J1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
6430531B16RikQ3V2J1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
6430531B16RikQ3V2J1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
6430531B16RikQ3V2J1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
6430531B16RikQ3V2J1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
6430531B16RikQ3V2J1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
6430531B16RikQ3V2J1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
6430531B16RikQ3V2J1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms