Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap9-3Q3V2C1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap9-3Q3V2C1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap9-3Q3V2C1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Krtap9-3Q3V2C1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap9-3Q3V2C1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap9-3Q3V2C1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Krtap9-3Q3V2C1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krtap9-3Q3V2C1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Krtap9-3Q3V2C1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Krtap9-3Q3V2C1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Krtap9-3Q3V2C1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Krtap9-3Q3V2C1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms