Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ccdc185Q3V118 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ccdc185Q3V118 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Ccdc185Q3V118 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Ccdc185Q3V118 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Ccdc185Q3V118 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc185Q3V118 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc185Q3V118 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc185Q3V118 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ccdc185Q3V118 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccdc185Q3V118 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccdc185Q3V118 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccdc185Q3V118 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccdc185Q3V118 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccdc185Q3V118 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccdc185Q3V118 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccdc185Q3V118 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccdc185Q3V118 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ccdc185Q3V118 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25,36■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccdc185Q3V118 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccdc185Q3V118 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccdc185Q3V118 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccdc185Q3V118 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ccdc185Q3V118 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ccdc185Q3V118 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ccdc185Q3V118 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ccdc185Q3V118 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ccdc185Q3V118 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Ccdc185Q3V118 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ccdc185Q3V118 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc185Q3V118 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25,16■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Ccdc185Q3V118 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ccdc185Q3V118 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ccdc185Q3V118 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ccdc185Q3V118 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ccdc185Q3V118 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc185Q3V118 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ccdc185Q3V118 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,8 ms