Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn34b4Q3V0X2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn34b4Q3V0X2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn34b4Q3V0X2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn34b4Q3V0X2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn34b4Q3V0X2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn34b4Q3V0X2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn34b4Q3V0X2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn34b4Q3V0X2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn34b4Q3V0X2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn34b4Q3V0X2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn34b4Q3V0X2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn34b4Q3V0X2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn34b4Q3V0X2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn34b4Q3V0X2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn34b4Q3V0X2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn34b4Q3V0X2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn34b4Q3V0X2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn34b4Q3V0X2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn34b4Q3V0X2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn34b4Q3V0X2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cldn34b4Q3V0X2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn34b4Q3V0X2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cldn34b4Q3V0X2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn34b4Q3V0X2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cldn34b4Q3V0X2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cldn34b4Q3V0X2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cldn34b4Q3V0X2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cldn34b4Q3V0X2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn34b4Q3V0X2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cldn34b4Q3V0X2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn34b4Q3V0X2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cldn34b4Q3V0X2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn34b4Q3V0X2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cldn34b4Q3V0X2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn34b4Q3V0X2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cldn34b4Q3V0X2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn34b4Q3V0X2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cldn34b4Q3V0X2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn34b4Q3V0X2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn34b4Q3V0X2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms