Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930596D02RikQ3V0H9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930596D02RikQ3V0H9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930596D02RikQ3V0H9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms