Protein–RNA interactions for Protein: Q3V053

4933427I04Rik, Riken cDNA 4933427I04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933427I04RikQ3V053 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4933427I04RikQ3V053 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4933427I04RikQ3V053 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4933427I04RikQ3V053 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
4933427I04RikQ3V053 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28■■■□□ 2.07
4933427I04RikQ3V053 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4933427I04RikQ3V053 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4933427I04RikQ3V053 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4933427I04RikQ3V053 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
4933427I04RikQ3V053 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4933427I04RikQ3V053 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
4933427I04RikQ3V053 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4933427I04RikQ3V053 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
4933427I04RikQ3V053 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
4933427I04RikQ3V053 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
4933427I04RikQ3V053 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
4933427I04RikQ3V053 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
4933427I04RikQ3V053 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
4933427I04RikQ3V053 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
4933427I04RikQ3V053 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
4933427I04RikQ3V053 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
4933427I04RikQ3V053 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
4933427I04RikQ3V053 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4933427I04RikQ3V053 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
4933427I04RikQ3V053 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
4933427I04RikQ3V053 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4933427I04RikQ3V053 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
4933427I04RikQ3V053 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
4933427I04RikQ3V053 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
4933427I04RikQ3V053 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
4933427I04RikQ3V053 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4933427I04RikQ3V053 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4933427I04RikQ3V053 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4933427I04RikQ3V053 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4933427I04RikQ3V053 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4933427I04RikQ3V053 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
4933427I04RikQ3V053 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
4933427I04RikQ3V053 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933427I04RikQ3V053 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4933427I04RikQ3V053 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4933427I04RikQ3V053 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4933427I04RikQ3V053 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
4933427I04RikQ3V053 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
4933427I04RikQ3V053 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4933427I04RikQ3V053 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4933427I04RikQ3V053 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
4933427I04RikQ3V053 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933427I04RikQ3V053 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933427I04RikQ3V053 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
4933427I04RikQ3V053 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
4933427I04RikQ3V053 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
4933427I04RikQ3V053 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
4933427I04RikQ3V053 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
4933427I04RikQ3V053 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
4933427I04RikQ3V053 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
4933427I04RikQ3V053 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
4933427I04RikQ3V053 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4933427I04RikQ3V053 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4933427I04RikQ3V053 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
4933427I04RikQ3V053 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms