Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnaaf3Q3UYV8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaaf3Q3UYV8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnaaf3Q3UYV8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaaf3Q3UYV8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnaaf3Q3UYV8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf3Q3UYV8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf3Q3UYV8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf3Q3UYV8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaaf3Q3UYV8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaaf3Q3UYV8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnaaf3Q3UYV8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnaaf3Q3UYV8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaaf3Q3UYV8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnaaf3Q3UYV8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnaaf3Q3UYV8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnaaf3Q3UYV8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnaaf3Q3UYV8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnaaf3Q3UYV8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnaaf3Q3UYV8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaaf3Q3UYV8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnaaf3Q3UYV8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf3Q3UYV8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dnaaf3Q3UYV8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf3Q3UYV8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dnaaf3Q3UYV8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dnaaf3Q3UYV8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dnaaf3Q3UYV8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnaaf3Q3UYV8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dnaaf3Q3UYV8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dnaaf3Q3UYV8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dnaaf3Q3UYV8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf3Q3UYV8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf3Q3UYV8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf3Q3UYV8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf3Q3UYV8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf3Q3UYV8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dnaaf3Q3UYV8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dnaaf3Q3UYV8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dnaaf3Q3UYV8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms