Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BB287469Q3UT53 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BB287469Q3UT53 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BB287469Q3UT53 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BB287469Q3UT53 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BB287469Q3UT53 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BB287469Q3UT53 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BB287469Q3UT53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BB287469Q3UT53 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BB287469Q3UT53 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
BB287469Q3UT53 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BB287469Q3UT53 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BB287469Q3UT53 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BB287469Q3UT53 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BB287469Q3UT53 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BB287469Q3UT53 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BB287469Q3UT53 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BB287469Q3UT53 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BB287469Q3UT53 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BB287469Q3UT53 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BB287469Q3UT53 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BB287469Q3UT53 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms