Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CrxosQ3UL53 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CrxosQ3UL53 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CrxosQ3UL53 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrxosQ3UL53 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CrxosQ3UL53 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrxosQ3UL53 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrxosQ3UL53 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CrxosQ3UL53 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CrxosQ3UL53 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CrxosQ3UL53 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CrxosQ3UL53 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CrxosQ3UL53 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CrxosQ3UL53 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrxosQ3UL53 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CrxosQ3UL53 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CrxosQ3UL53 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CrxosQ3UL53 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CrxosQ3UL53 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms