Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330014E10RikQ3UL33 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
E330014E10RikQ3UL33 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330014E10RikQ3UL33 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330014E10RikQ3UL33 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330014E10RikQ3UL33 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E330014E10RikQ3UL33 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E330014E10RikQ3UL33 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
E330014E10RikQ3UL33 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
E330014E10RikQ3UL33 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
E330014E10RikQ3UL33 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E330014E10RikQ3UL33 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
E330014E10RikQ3UL33 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
E330014E10RikQ3UL33 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E330014E10RikQ3UL33 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E330014E10RikQ3UL33 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E330014E10RikQ3UL33 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E330014E10RikQ3UL33 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E330014E10RikQ3UL33 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E330014E10RikQ3UL33 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
E330014E10RikQ3UL33 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E330014E10RikQ3UL33 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E330014E10RikQ3UL33 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E330014E10RikQ3UL33 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E330014E10RikQ3UL33 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E330014E10RikQ3UL33 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E330014E10RikQ3UL33 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E330014E10RikQ3UL33 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E330014E10RikQ3UL33 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E330014E10RikQ3UL33 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
E330014E10RikQ3UL33 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E330014E10RikQ3UL33 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
E330014E10RikQ3UL33 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E330014E10RikQ3UL33 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
E330014E10RikQ3UL33 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
E330014E10RikQ3UL33 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
E330014E10RikQ3UL33 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
E330014E10RikQ3UL33 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E330014E10RikQ3UL33 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
E330014E10RikQ3UL33 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
E330014E10RikQ3UL33 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
E330014E10RikQ3UL33 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E330014E10RikQ3UL33 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E330014E10RikQ3UL33 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
E330014E10RikQ3UL33 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
E330014E10RikQ3UL33 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
E330014E10RikQ3UL33 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
E330014E10RikQ3UL33 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
E330014E10RikQ3UL33 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330014E10RikQ3UL33 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
E330014E10RikQ3UL33 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E330014E10RikQ3UL33 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E330014E10RikQ3UL33 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E330014E10RikQ3UL33 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E330014E10RikQ3UL33 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E330014E10RikQ3UL33 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E330014E10RikQ3UL33 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E330014E10RikQ3UL33 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms