Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Smu1Q3UKJ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smu1Q3UKJ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smu1Q3UKJ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smu1Q3UKJ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smu1Q3UKJ7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smu1Q3UKJ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smu1Q3UKJ7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smu1Q3UKJ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smu1Q3UKJ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smu1Q3UKJ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smu1Q3UKJ7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smu1Q3UKJ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smu1Q3UKJ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smu1Q3UKJ7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smu1Q3UKJ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smu1Q3UKJ7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smu1Q3UKJ7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smu1Q3UKJ7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smu1Q3UKJ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smu1Q3UKJ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smu1Q3UKJ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smu1Q3UKJ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smu1Q3UKJ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smu1Q3UKJ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smu1Q3UKJ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smu1Q3UKJ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smu1Q3UKJ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smu1Q3UKJ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smu1Q3UKJ7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smu1Q3UKJ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smu1Q3UKJ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smu1Q3UKJ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smu1Q3UKJ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smu1Q3UKJ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smu1Q3UKJ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smu1Q3UKJ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smu1Q3UKJ7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smu1Q3UKJ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smu1Q3UKJ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smu1Q3UKJ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smu1Q3UKJ7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms