Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc177Q3UHB8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc177Q3UHB8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc177Q3UHB8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc177Q3UHB8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc177Q3UHB8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc177Q3UHB8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms