Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGC7

Eif3j1, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3j1Q3UGC7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Eif3j1Q3UGC7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Eif3j1Q3UGC7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Eif3j1Q3UGC7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Eif3j1Q3UGC7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Eif3j1Q3UGC7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Eif3j1Q3UGC7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Eif3j1Q3UGC7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Eif3j1Q3UGC7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Eif3j1Q3UGC7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Eif3j1Q3UGC7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Eif3j1Q3UGC7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Eif3j1Q3UGC7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Eif3j1Q3UGC7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Eif3j1Q3UGC7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Eif3j1Q3UGC7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Eif3j1Q3UGC7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Eif3j1Q3UGC7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Eif3j1Q3UGC7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Eif3j1Q3UGC7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Eif3j1Q3UGC7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Eif3j1Q3UGC7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Eif3j1Q3UGC7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Eif3j1Q3UGC7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Eif3j1Q3UGC7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Eif3j1Q3UGC7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Eif3j1Q3UGC7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Eif3j1Q3UGC7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Eif3j1Q3UGC7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Eif3j1Q3UGC7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Eif3j1Q3UGC7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Eif3j1Q3UGC7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Eif3j1Q3UGC7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Eif3j1Q3UGC7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Eif3j1Q3UGC7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Eif3j1Q3UGC7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Eif3j1Q3UGC7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Eif3j1Q3UGC7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Eif3j1Q3UGC7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Eif3j1Q3UGC7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Eif3j1Q3UGC7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Eif3j1Q3UGC7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Eif3j1Q3UGC7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Eif3j1Q3UGC7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Eif3j1Q3UGC7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Eif3j1Q3UGC7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Eif3j1Q3UGC7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Eif3j1Q3UGC7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Eif3j1Q3UGC7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Eif3j1Q3UGC7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Eif3j1Q3UGC7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Eif3j1Q3UGC7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Eif3j1Q3UGC7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Eif3j1Q3UGC7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Eif3j1Q3UGC7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif3j1Q3UGC7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Eif3j1Q3UGC7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Eif3j1Q3UGC7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Eif3j1Q3UGC7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Eif3j1Q3UGC7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Eif3j1Q3UGC7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Eif3j1Q3UGC7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eif3j1Q3UGC7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eif3j1Q3UGC7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eif3j1Q3UGC7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Eif3j1Q3UGC7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif3j1Q3UGC7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif3j1Q3UGC7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eif3j1Q3UGC7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Eif3j1Q3UGC7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Eif3j1Q3UGC7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eif3j1Q3UGC7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Eif3j1Q3UGC7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eif3j1Q3UGC7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms