Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf166Q3U9F6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf166Q3U9F6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf166Q3U9F6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf166Q3U9F6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf166Q3U9F6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf166Q3U9F6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf166Q3U9F6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf166Q3U9F6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf166Q3U9F6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf166Q3U9F6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf166Q3U9F6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf166Q3U9F6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf166Q3U9F6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf166Q3U9F6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf166Q3U9F6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf166Q3U9F6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf166Q3U9F6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf166Q3U9F6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf166Q3U9F6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf166Q3U9F6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf166Q3U9F6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf166Q3U9F6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf166Q3U9F6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf166Q3U9F6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf166Q3U9F6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf166Q3U9F6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf166Q3U9F6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf166Q3U9F6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rnf166Q3U9F6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf166Q3U9F6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf166Q3U9F6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf166Q3U9F6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf166Q3U9F6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf166Q3U9F6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf166Q3U9F6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf166Q3U9F6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf166Q3U9F6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf166Q3U9F6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf166Q3U9F6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf166Q3U9F6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf166Q3U9F6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf166Q3U9F6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf166Q3U9F6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf166Q3U9F6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rnf166Q3U9F6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf166Q3U9F6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf166Q3U9F6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms