Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3U595 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3U595 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3U595 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3U595 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3U595 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3U595 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3U595 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3U595 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3U595 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3U595 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3U595 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3U595 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3U595 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3U595 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3U595 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3U595 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3U595 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3U595 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3U595 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3U595 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3U595 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3U595 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3U595 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U595 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3U595 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3U595 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3U595 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3U595 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3U595 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3U595 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3U595 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3U595 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3U595 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3U595 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q3U595 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3U595 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3U595 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3U595 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3U595 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3U595 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3U595 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3U595 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3U595 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q3U595 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3U595 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3U595 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3U595 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3U595 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3U595 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U595 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U595 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U595 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3U595 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3U595 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3U595 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3U595 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3U595 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3U595 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U595 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q3U595 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q3U595 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q3U595 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U595 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U595 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U595 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q3U595 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3U595 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3U595 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q3U595 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3U595 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q3U595 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3U595 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3U595 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U595 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U595 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U595 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3U595 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3U595 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3U595 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3U595 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3U595 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3U595 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3U595 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U595 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U595 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U595 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U595 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U595 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U595 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U595 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U595 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3U595 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U595 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U595 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3U595 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3U595 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3U595 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3U595 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3U595 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms