Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gse1Q3U3C9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gse1Q3U3C9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gse1Q3U3C9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gse1Q3U3C9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gse1Q3U3C9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gse1Q3U3C9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gse1Q3U3C9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gse1Q3U3C9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gse1Q3U3C9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gse1Q3U3C9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gse1Q3U3C9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gse1Q3U3C9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gse1Q3U3C9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gse1Q3U3C9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gse1Q3U3C9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gse1Q3U3C9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gse1Q3U3C9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gse1Q3U3C9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Gse1Q3U3C9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gse1Q3U3C9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gse1Q3U3C9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gse1Q3U3C9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gse1Q3U3C9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gse1Q3U3C9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gse1Q3U3C9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gse1Q3U3C9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gse1Q3U3C9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gse1Q3U3C9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gse1Q3U3C9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gse1Q3U3C9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gse1Q3U3C9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gse1Q3U3C9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gse1Q3U3C9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gse1Q3U3C9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gse1Q3U3C9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gse1Q3U3C9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gse1Q3U3C9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gse1Q3U3C9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gse1Q3U3C9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gse1Q3U3C9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gse1Q3U3C9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gse1Q3U3C9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms