Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctu2Q3U308 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu2Q3U308 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu2Q3U308 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctu2Q3U308 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctu2Q3U308 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctu2Q3U308 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctu2Q3U308 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctu2Q3U308 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctu2Q3U308 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctu2Q3U308 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctu2Q3U308 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctu2Q3U308 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu2Q3U308 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu2Q3U308 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu2Q3U308 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctu2Q3U308 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctu2Q3U308 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctu2Q3U308 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctu2Q3U308 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctu2Q3U308 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctu2Q3U308 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctu2Q3U308 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctu2Q3U308 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctu2Q3U308 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctu2Q3U308 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctu2Q3U308 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctu2Q3U308 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctu2Q3U308 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctu2Q3U308 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctu2Q3U308 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctu2Q3U308 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctu2Q3U308 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctu2Q3U308 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu2Q3U308 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctu2Q3U308 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctu2Q3U308 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctu2Q3U308 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctu2Q3U308 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctu2Q3U308 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctu2Q3U308 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctu2Q3U308 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms