Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam193bQ3U2K0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam193bQ3U2K0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fam193bQ3U2K0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam193bQ3U2K0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fam193bQ3U2K0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam193bQ3U2K0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam193bQ3U2K0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam193bQ3U2K0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam193bQ3U2K0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fam193bQ3U2K0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fam193bQ3U2K0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam193bQ3U2K0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam193bQ3U2K0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam193bQ3U2K0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam193bQ3U2K0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam193bQ3U2K0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fam193bQ3U2K0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam193bQ3U2K0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam193bQ3U2K0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam193bQ3U2K0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam193bQ3U2K0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fam193bQ3U2K0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fam193bQ3U2K0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fam193bQ3U2K0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam193bQ3U2K0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fam193bQ3U2K0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam193bQ3U2K0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam193bQ3U2K0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fam193bQ3U2K0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fam193bQ3U2K0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fam193bQ3U2K0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fam193bQ3U2K0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam193bQ3U2K0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fam193bQ3U2K0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam193bQ3U2K0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam193bQ3U2K0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fam193bQ3U2K0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam193bQ3U2K0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam193bQ3U2K0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fam193bQ3U2K0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fam193bQ3U2K0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam193bQ3U2K0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fam193bQ3U2K0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fam193bQ3U2K0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam193bQ3U2K0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fam193bQ3U2K0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam193bQ3U2K0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam193bQ3U2K0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fam193bQ3U2K0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms